基于數(shù)字簽名與Trie的OPSM索引與約束查詢
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目前，基因芯片技術(shù)飛速發(fā)展，促使生物學(xué)家積累了大量的不同實(shí)驗(yàn)條件下的基因表達(dá)數(shù)據(jù)．事實(shí)證明，基因芯片數(shù)據(jù)分析在理解基因功能、基因調(diào)控和分子生命過程中發(fā)揮著重要作用．保序子矩陣（order-preserving submatrix，簡稱OPSM）是基因芯片數(shù)據(jù)分析技術(shù)中的一種有效模型，其可以發(fā)現(xiàn)在部分基因和不同實(shí)驗(yàn)條件下具有相同表達(dá)趨勢的聚類．在分析基因表達(dá)機(jī)理的過程中，OPSM的檢索無疑節(jié)省了生物學(xué)家的時(shí)間與精力．目前，OPSM的查詢主要是基于關(guān)鍵詞的檢索方法，但是分析者對(duì)結(jié)果具有微弱的控制力，通常，分析者所能決定的臨時(shí)的參數(shù)設(shè)置往往偏離其領(lǐng)域知識(shí)。致使檢索結(jié)果與真實(shí)想要的結(jié)果相去甚遠(yuǎn)．為了解決上述問題。提出兩類基于數(shù)字簽名與Trie的OPSM索引與約束查詢方法．在真實(shí)數(shù)據(jù)上進(jìn)行了大量的實(shí)驗(yàn)，實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明，所提出的方法具有良好的有效性與可擴(kuò)展性。
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