隨機游走的蛋白質功能預測算法
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標簽：預測算法(8194)
針對單一數據源預測蛋白質功能效果不佳以及蛋白質相互作用網絡信息不完全等問題，提出一種多數據源融合和基于雙重索引矩陣的隨機游走的蛋白質功能預測（ MSI-RWDIM）算法。該算法使用了蛋白質序列、基因表達和蛋白質相互作用數據預測蛋白質功能，并根據這些數據源特性構建相應的相互作用加權網絡；然后融合各數據源加權網絡并結合功能相關性網絡構建雙重索引矩陣，使用隨機游走算法計算得分進而預測蛋白質功能。在酵母數據集的五折交叉驗證中，MSI-RWDIM算法具有較高的準確率和較低的覆蓋率，還可降低功能標簽損失率。研究結果表明，MSI-RWDIM算法的總體性能優(yōu)于常用的K近鄰、直推式多標簽集成分類和快速同步加權方法。
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