基因芯片是提升育種效率、培育抗病、抗逆及優(yōu)質(zhì)等新品種的重要分子工具。近年來(lái),針對(duì)對(duì)蝦基因組育種缺乏低成本、高通量的基因芯片現(xiàn)狀,中國(guó)水產(chǎn)科學(xué)研究院黃海水產(chǎn)研究所孔杰研究員團(tuán)隊(duì)研制出40K SNP基因芯片“黃海芯1號(hào)”。
依據(jù)多代系譜,采用一步法基因組選擇技術(shù),“黃海芯1號(hào)”已經(jīng)應(yīng)用于對(duì)蝦的商業(yè)化育種中,在提高致急性肝胰腺壞死病副溶血弧菌(VpAHPND)、白斑綜合征病毒(WSSV)抗性和生長(zhǎng)速度等方面取得顯著進(jìn)展。
研究團(tuán)隊(duì)對(duì)世界上重要對(duì)蝦養(yǎng)殖群體和品系進(jìn)行了全基因組重測(cè)序,獲得6百萬(wàn)個(gè)有效SNP標(biāo)記,經(jīng)過(guò)整合WSSV抗性、氨氮耐受性、飼料轉(zhuǎn)化效率等相關(guān)SNP位點(diǎn),選留45815個(gè)標(biāo)記并構(gòu)建了液相芯片。
利用該芯片的基因型檢測(cè)結(jié)果,對(duì)VpAHPND和WSSV侵染的抗性開展一步法基因組選擇,準(zhǔn)確性比傳統(tǒng)的BLUP方法高29%-91%。該團(tuán)隊(duì)已經(jīng)與石家莊博瑞迪生物技術(shù)有限公司簽約,聯(lián)合開展育種技術(shù)服務(wù)與SNP基因型檢測(cè)服務(wù)。目前,“黃海芯1號(hào)”已推廣應(yīng)用于4個(gè)凡納濱對(duì)蝦的遺傳育種項(xiàng)目,分型個(gè)體數(shù)量超過(guò)2000尾。
對(duì)蝦40K SNP育種芯片“黃海芯1號(hào)”的研發(fā),為凡納濱對(duì)蝦基因組親緣關(guān)系鑒定、遺傳結(jié)構(gòu)與遺傳多樣性分析、多性狀基因組選擇等提供了重要工具,對(duì)進(jìn)一步推動(dòng)對(duì)蝦種業(yè)的快速發(fā)展起到至關(guān)重要的作用。
編輯:jq
-
基因芯片
+關(guān)注
關(guān)注
0文章
21瀏覽量
10669
原文標(biāo)題:基因芯片“黃海芯1號(hào)”,助力對(duì)蝦育種
文章出處:【微信號(hào):Micro-Fluidics,微信公眾號(hào):微流控】歡迎添加關(guān)注!文章轉(zhuǎn)載請(qǐng)注明出處。
發(fā)布評(píng)論請(qǐng)先 登錄
相關(guān)推薦
評(píng)論