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基于FPGA的GNN加速器頂層架構(gòu)

65eE_Broadcom_C ? 來源:Achronix ? 作者:Achronix ? 2021-08-27 09:44 ? 次閱讀

接上一篇......

GNN加速器頂層架構(gòu)

此GNN加速器是為GraphSAGE算法設(shè)計的,但是它的設(shè)計也可以應(yīng)用于其他類似的GNN算法加速。其頂層架構(gòu)如下圖所示。

該架構(gòu)由以下模塊組成:

圖中的GNN內(nèi)核是算法實現(xiàn)的核心部分(詳情如下)。

RoCE-Lite是RDMA協(xié)議的輕量級版本,用于通過高速以太網(wǎng)進(jìn)行遠(yuǎn)程存儲訪問,以支持海量節(jié)點的圖計算。

400GE以太網(wǎng)控制器用于承載RoCE-Lite協(xié)議。

GDDR6存儲器用于存儲GNN處理過程中所需的高速訪問數(shù)據(jù)(DDR4作為備用大容量存儲器)。該存儲器用于存儲訪問頻率相對較低的數(shù)據(jù),例如待預(yù)處理的圖形數(shù)據(jù)。

PCIeGen5 ×16 接口提供高速主機(jī)接口,用于與服務(wù)器軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)交互。

上述所有模塊均通過具有高帶寬的NoC實現(xiàn)互連。

GNN內(nèi)核微架構(gòu)

在開始討論GNN內(nèi)核的微架構(gòu)之前,有必要先回顧一下GraphSAGE算法。其內(nèi)層循環(huán)的聚合和合并(包括卷積)占據(jù)了該算法的大部分計算和存儲訪問。通過研究,我們得出這兩個步驟的特點,具體如下。

表2:GNN算法中聚合和合并操作的對比(來源:https://arxiv.org/abs/1908.10834)

步驟 聚合操作 合并操作
存儲訪問方式 間接訪問,不規(guī)則 直接訪問,規(guī)則
數(shù)據(jù)重用
計算模式 動態(tài),不規(guī)則 靜態(tài),規(guī)則
計算量
性能瓶頸 存儲 計算

可以看出,聚合操作和合并操作在計算和存儲訪問模式上有著完全不同的需求。聚合操作涉及相鄰節(jié)點的采樣。然而,圖形是一種非歐幾里得數(shù)據(jù)類型——它的大小和維度是不確定且無序,矩陣稀疏,節(jié)點位置隨機(jī)。因此,存儲訪問是不規(guī)則的,并且難以重復(fù)利用數(shù)據(jù)。

在合并操作中,輸入數(shù)據(jù)是聚合結(jié)果(節(jié)點的低維表示)和權(quán)重矩陣。它的大小和維度是固定的,具有線性存儲位置。因此對存儲訪問沒有挑戰(zhàn),但是矩陣的計算量非常大。 基于上述分析,我們決定在GNN內(nèi)核加速器設(shè)計中選擇使用兩種不同的硬件結(jié)構(gòu)來分別處理聚合和合并操作(如下圖示):

聚合器——通過單指令多數(shù)據(jù)(SIMD)處理器陣列,對圖形相鄰節(jié)點進(jìn)行采樣和聚合。單指令可以預(yù)定義為mean()平均值計算,或其他適用的聚合函數(shù);多數(shù)據(jù)是指單次mean()均值計算中需要多個相鄰節(jié)點的特征數(shù)據(jù)作為輸入,這些數(shù)據(jù)來自子圖采樣器。SIMD處理器陣列通過調(diào)度器Agg Scheduler進(jìn)行負(fù)載平衡。子圖采樣器通過NoC從GDDR6或DDR4讀回的鄰接矩陣和節(jié)點特征數(shù)據(jù)h0v分別緩存在鄰接列表緩沖區(qū)(Adjacent ListBuffer)和節(jié)點特征緩沖區(qū)(Node Feature Buffer)。聚合的結(jié)果hkN(v)存儲在聚合緩沖區(qū)(Aggregation Buffer)中。

合并器——通過脈動矩陣PE對聚合結(jié)果進(jìn)行卷積運算。卷積核是Wk權(quán)重矩陣。卷積結(jié)果由ReLU激活函數(shù)進(jìn)行非線性處理,同時也存儲在PartialSum Buffer中,以用于下一輪迭代。

合并結(jié)果經(jīng)過L2BN標(biāo)準(zhǔn)化處理后,即為最終的節(jié)點表示hkv。在一個典型的節(jié)點分類預(yù)測應(yīng)用中,節(jié)點表示hkv可以通過一個全連接層(FC)來獲取節(jié)點的分類標(biāo)簽。這個過程是傳統(tǒng)的機(jī)器學(xué)習(xí)處理方法之一,在GraphSAGE文獻(xiàn)資料中沒有體現(xiàn),這個功能也沒有包含在這個架構(gòu)中。

責(zé)任編輯:haq

聲明:本文內(nèi)容及配圖由入駐作者撰寫或者入駐合作網(wǎng)站授權(quán)轉(zhuǎn)載。文章觀點僅代表作者本人,不代表電子發(fā)燒友網(wǎng)立場。文章及其配圖僅供工程師學(xué)習(xí)之用,如有內(nèi)容侵權(quán)或者其他違規(guī)問題,請聯(lián)系本站處理。 舉報投訴
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原文標(biāo)題:白皮書:一種基于FPGA的圖神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)加速器解決方案(WP024)(第二部分)

文章出處:【微信號:Broadcom_China,微信公眾號:博通Broadcom】歡迎添加關(guān)注!文章轉(zhuǎn)載請注明出處。

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