簡(jiǎn) 介:據(jù)《福布斯》報(bào)道,每天大約會(huì)有 250 萬字節(jié)的數(shù)據(jù)被產(chǎn)生。然后,可以使用數(shù)據(jù)科學(xué)和機(jī)器學(xué)習(xí)技術(shù)對(duì)這些數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,以便提供分析和作出預(yù)測(cè)。盡管在大多數(shù)情況下,在開始任何統(tǒng)計(jì)分析之前,需要先對(duì)最初收集的數(shù)據(jù)進(jìn)行預(yù)處理。有許多不同的原因?qū)е滦枰M(jìn)行預(yù)處理分析,例如:
收集的數(shù)據(jù)格式不對(duì)(如 SQL 數(shù)據(jù)庫、JSON、CSV 等)
缺失值和異常值
標(biāo)準(zhǔn)化
減少數(shù)據(jù)集中存在的固有噪聲(部分存儲(chǔ)數(shù)據(jù)可能已損壞)
數(shù)據(jù)集中的某些功能可能無法收集任何信息以供分析
在本文中,我將介紹如何使用 python 減少 kaggle Mushroom Classification 數(shù)據(jù)集中的特性數(shù)量。本文中使用的所有代碼在?kaggle 和我的?github 帳號(hào)上都有。減少統(tǒng)計(jì)分析期間要使用的特征的數(shù)量可能會(huì)帶來一些好處,例如:
提高精度
降低過擬合風(fēng)險(xiǎn)
加快訓(xùn)練速度
改進(jìn)數(shù)據(jù)可視化
增加我們模型的可解釋性
事實(shí)上,統(tǒng)計(jì)上證明,當(dāng)執(zhí)行機(jī)器學(xué)習(xí)任務(wù)時(shí),存在針對(duì)每個(gè)特定任務(wù)應(yīng)該使用的最佳數(shù)量的特征(圖 1)。如果添加的特征比必要的特征多,那么我們的模型性能將下降(因?yàn)樘砑恿嗽肼暎U嬲奶魬?zhàn)是找出哪些特征是最佳的使用特征(這實(shí)際上取決于我們提供的數(shù)據(jù)量和我們正在努力實(shí)現(xiàn)的任務(wù)的復(fù)雜性)。這就是特征選擇技術(shù)能夠幫到我們的地方!
圖 1:分類器性能和維度之間的關(guān)系特征選擇 有許多不同的方法可用于特征選擇。其中最重要的是:1.過濾方法=過濾我們的數(shù)據(jù)集,只取包含所有相關(guān)特征的子集(例如,使用 Pearson 相關(guān)的相關(guān)矩陣)。2.遵循過濾方法的相同目標(biāo),但使用機(jī)器學(xué)習(xí)模型作為其評(píng)估標(biāo)準(zhǔn)(例如,向前/向后/雙向/遞歸特征消除)。我們將一些特征輸入機(jī)器學(xué)習(xí)模型,評(píng)估它們的性能,然后決定是否添加或刪除特征以提高精度。因此,這種方法可以比濾波更精確,但計(jì)算成本更高。3.嵌入方法。與過濾方法一樣,嵌入方法也使用機(jī)器學(xué)習(xí)模型。這兩種方法的區(qū)別在于,嵌入的方法檢查 ML 模型的不同訓(xùn)練迭代,然后根據(jù)每個(gè)特征對(duì) ML 模型訓(xùn)練的貢獻(xiàn)程度對(duì)每個(gè)特征的重要性進(jìn)行排序。
圖 2:過濾器、包裝器和嵌入式方法表示 [3]實(shí)踐 在本文中,我將使用 Mushroom Classification 數(shù)據(jù)集,通過查看給定的特征來嘗試預(yù)測(cè)蘑菇是否有毒。在這樣做的同時(shí),我們將嘗試不同的特征消除技術(shù),看看它們會(huì)如何影響訓(xùn)練時(shí)間和模型整體的精度。首先,我們需要導(dǎo)入所有必需的庫。
X = df.drop(['class'], axis = 1)
Y = df['class']
X = pd.get_dummies(X, prefix_sep='_')
Y = LabelEncoder().fit_transform(Y)
X2 = StandardScaler().fit_transform(X)
X_Train, X_Test, Y_Train, Y_Test = train_test_split(X2, Y, test_size = 0.30,
特征重要性
基于集合的決策樹模型(如隨機(jī)森林)可以用來對(duì)不同特征的重要性進(jìn)行排序。了解我們的模型最重要的特征對(duì)于理解我們的模型如何做出預(yù)測(cè)(使其更易于解釋)是至關(guān)重要的。同時(shí),我們可以去掉那些對(duì)我們的模型沒有任何好處的特征。
start = time.process_time()
trainedforest = RandomForestClassifier(n_estimators=700).fit(X_Train,Y_Train)
print(time.process_time() - start)
predictionforest = trainedforest.predict(X_Test)
print(confusion_matrix(Y_Test,predictionforest))
print(classification_report(Y_Test,predictionforest))
如下圖所示,使用所有特征訓(xùn)練一個(gè)隨機(jī)森林分類器,在大約 2.2 秒的訓(xùn)練時(shí)間內(nèi)獲得 100% 的準(zhǔn)確率。在下面的每個(gè)示例中,每個(gè)模型的訓(xùn)練時(shí)間都將打印在每個(gè)片段的第一行,供你參考。
一旦我們的隨機(jī)森林分類器得到訓(xùn)練,我們就可以創(chuàng)建一個(gè)特征重要性圖,看看哪些特征對(duì)我們的模型預(yù)測(cè)來說是最重要的(圖 4)。在本例中,下面只顯示了前 7 個(gè)特性。
figure(num=None, figsize=(20, 22), dpi=80, facecolor='w', edgecolor='k')
feat_importances = pd.Series(trainedforest.feature_importances_, index= X.columns)
feat_importances.nlargest(7).plot(kind='barh')
X_Reduced = X[['odor_n','odor_f', 'gill-size_n','gill-size_b']]
X_Reduced = StandardScaler().fit_transform(X_Reduced)
X_Train2, X_Test2, Y_Train2, Y_Test2 = train_test_split(X_Reduced, Y, test_size = 0.30, random_state = 101)
start = time.process_time()
trainedforest = RandomForestClassifier(n_estimators=700).fit(X_Train2,Y_Train2)
print(time.process_time() - start)
predictionforest = trainedforest.predict(X_Test2)
print(confusion_matrix(Y_Test2,predictionforest))
print(classification_report(Y_Test2,predictionforest))
正如我們?cè)谙旅婵吹降模瑑H僅使用 3 個(gè)特征,只會(huì)導(dǎo)致準(zhǔn)確率下降 0.03%,訓(xùn)練時(shí)間減少一半。
start = time.process_time()
trainedtree = tree.DecisionTreeClassifier().fit(X_Train, Y_Train)
print(time.process_time() - start)
predictionstree = trainedtree.predict(X_Test)
print(confusion_matrix(Y_Test,predictionstree))
print(classification_report(Y_Test,predictionstree))
import graphviz
from sklearn.tree import DecisionTreeClassifier, export_graphviz
data = export_graphviz(trainedtree,out_file=None,feature_names= X.columns,
class_names=['edible', 'poisonous'],
filled=True, rounded=True,
max_depth=2,
special_characters=True)
graph = graphviz.Source(data)
graph
圖 5:決策樹可視化
遞歸特征消除(RFE)
遞歸特征消除(RFE)將機(jī)器學(xué)習(xí)模型的實(shí)例和要使用的最終期望特征數(shù)作為輸入。然后,它遞歸地減少要使用的特征的數(shù)量,采用的方法是使用機(jī)器學(xué)習(xí)模型精度作為度量對(duì)它們進(jìn)行排序。創(chuàng)建一個(gè) for 循環(huán),其中輸入特征的數(shù)量是我們的變量,這樣就可以通過跟蹤在每個(gè)循環(huán)迭代中注冊(cè)的精度,找出我們的模型所需的最佳特征數(shù)量。使用 RFE 支持方法,我們可以找出被評(píng)估為最重要的特征的名稱(rfe.support 返回一個(gè)布爾列表,其中 true 表示一個(gè)特征被視為重要,false 表示一個(gè)特征不重要)。
from sklearn.feature_selection import RFE
model = RandomForestClassifier(n_estimators=700)
rfe = RFE(model, 4)
start = time.process_time()
RFE_X_Train = rfe.fit_transform(X_Train,Y_Train)
RFE_X_Test = rfe.transform(X_Test)
rfe = rfe.fit(RFE_X_Train,Y_Train)
print(time.process_time() - start)
print("Overall Accuracy using RFE: ", rfe.score(RFE_X_Test,Y_Test))
SelecFromModel
selectfrommodel 是另一種 scikit 學(xué)習(xí)方法,可用于特征選擇。此方法可用于具有 coef 或 feature 重要性屬性的所有不同類型的 scikit 學(xué)習(xí)模型(擬合后)。與 rfe 相比,selectfrommodel 是一個(gè)不太可靠的解決方案。實(shí)際上,selectfrommodel 只是根據(jù)計(jì)算出的閾值(不涉及優(yōu)化迭代過程)刪除不太重要的特性。為了測(cè)試 selectfrommodel 的有效性,我決定在這個(gè)例子中使用一個(gè) ExtraTreesClassifier。ExtratreesClassifier(極端隨機(jī)樹)是基于樹的集成分類器,與隨機(jī)森林方法相比,它可以產(chǎn)生更少的方差(因此減少了過擬合的風(fēng)險(xiǎn))。隨機(jī)森林和極隨機(jī)樹的主要區(qū)別在于極隨機(jī)樹中節(jié)點(diǎn)的采樣不需要替換。
from sklearn.ensemble import ExtraTreesClassifier
from sklearn.feature_selection import SelectFromModel
model = ExtraTreesClassifier()
start = time.process_time()
model = model.fit(X_Train,Y_Train)
model = SelectFromModel(model, prefit=True)
print(time.process_time() - start)
Selected_X = model.transform(X_Train)
start = time.process_time()
trainedforest = RandomForestClassifier(n_estimators=700).fit(Selected_X, Y_Train)
print(time.process_time() - start)
Selected_X_Test = model.transform(X_Test)
predictionforest = trainedforest.predict(Selected_X_Test)
print(confusion_matrix(Y_Test,predictionforest))
print(classification_report(Y_Test,predictionforest))
-
如果兩個(gè)特征之間的相關(guān)性為 0,則意味著更改這兩個(gè)特征中的任何一個(gè)都不會(huì)影響另一個(gè)。
-
如果兩個(gè)特征之間的相關(guān)性大于 0,這意味著增加一個(gè)特征中的值也會(huì)增加另一個(gè)特征中的值(相關(guān)系數(shù)越接近 1,兩個(gè)不同特征之間的這種聯(lián)系就越強(qiáng))。
-
如果兩個(gè)特征之間的相關(guān)性小于 0,這意味著增加一個(gè)特征中的值將使減少另一個(gè)特征中的值(相關(guān)性系數(shù)越接近-1,兩個(gè)不同特征之間的這種關(guān)系將越強(qiáng))。
Numeric_df = pd.DataFrame(X)
Numeric_df['Y'] = Y
corr= Numeric_df.corr()
corr_y = abs(corr["Y"])
highest_corr = corr_y[corr_y >0.5]
highest_corr.sort_values(ascending=True)
figure(num=None, figsize=(12, 10), dpi=80, facecolor='w', edgecolor='k')
corr2 = Numeric_df[['bruises_f' , 'bruises_t' , 'gill-color_b' , 'gill-size_b' , 'gill-size_n' , 'ring-type_p' , 'stalk-surface-below-ring_k' , 'stalk-surface-above-ring_k' , 'odor_f', 'odor_n']].corr()
sns.heatmap(corr2, annot=True, fmt=".2g")
單變量選擇單變量特征選擇是一種統(tǒng)計(jì)方法,用于選擇與我們對(duì)應(yīng)標(biāo)簽關(guān)系最密切的特征。使用 selectkbest 方法,我們可以決定使用哪些指標(biāo)來評(píng)估我們的特征,以及我們希望保留的 k 個(gè)最佳特征的數(shù)量。根據(jù)我們的需要,提供不同類型的評(píng)分函數(shù):
-
Classification = chi2, f_classif, mutual_info_classif
-
Regression = f_regression, mutual_info_regression
from sklearn.feature_selection import SelectKBest
from sklearn.feature_selection import chi2
min_max_scaler = preprocessing.MinMaxScaler()
Scaled_X = min_max_scaler.fit_transform(X2)
X_new = SelectKBest(chi2, k=2).fit_transform(Scaled_X, Y)
X_Train3, X_Test3, Y_Train3, Y_Test3 = train_test_split(X_new, Y, test_size = 0.30, random_state = 101)
start = time.process_time()
trainedforest = RandomForestClassifier(n_estimators=700).fit(X_Train3,Y_Train3)
print(time.process_time() - start)
predictionforest = trainedforest.predict(X_Test3)
print(confusion_matrix(Y_Test3,predictionforest))
print(classification_report(Y_Test3,predictionforest))
from sklearn.linear_model import LassoCV
regr = LassoCV(cv=5, random_state=101)
regr.fit(X_Train,Y_Train)
print("LassoCV Best Alpha Scored: ", regr.alpha_)
print("LassoCV Model Accuracy: ", regr.score(X_Test, Y_Test))
model_coef = pd.Series(regr.coef_, index = list(X.columns[:-1]))
print("Variables Eliminated: ", str(sum(model_coef == 0)))
print("Variables Kept: ", str(sum(model_coef != 0)))
figure(num=None, figsize=(12, 10), dpi=80, facecolor='w', edgecolor='k')
top_coef = model_coef.sort_values()
top_coef[top_coef != 0].plot(kind = "barh")
plt.title("Most Important Features Identified using Lasso (!0)")
-
python
+關(guān)注
關(guān)注
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84801 -
數(shù)據(jù)集
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原文標(biāo)題:收藏 | 機(jī)器學(xué)習(xí)特征選擇方法總結(jié)
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