空間轉錄組的主要魅力就在于能夠獲取轉錄組的空間位置信息，在進行空間轉錄組測序實驗時，首先需要獲取感興趣的組織切片。而對于OCT包埋的組織來說，從不同方向進行切片所得到的結果是不同的。因此，在開展實驗時如何有效地與實驗操作人員溝通，對切片方向進行準確描述，從而順利獲得感興趣的組織切片十分重要！
完成組織包埋后，第一件事就是標記包埋盒并拍照記錄樣本情況。包埋盒默認方向如圖所示，E為包埋盒底面，F為包埋盒上方，逆時針依次標記為A、B、C、D。
可對組織進行三種維度的切片，分別是：水平面，冠狀面和矢狀面。文字描述有些抽象，我們不妨看圖。
0
1
水平面：從E往F切（或從F往E切）
0
2
矢狀面：從B往D切（或從D往B切）
0
3
冠狀面：從A往C切（或從C往A切）
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若無特別說明，SBC空間小分隊的伙伴們會默認從包埋盒底面開始切，就是從E往F面切。如果你所感興趣的組織切片并不是前面我們所描述的水平面，就需要在切片前與實驗操作人員充分溝通，準確描述你所期望的切片方向。
審核編輯：劉清
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原文標題：空間轉錄組實驗：如何準確描述OCT切片方向？
文章出處：【微信號：SBCNECB，微信公眾號：上海生物芯片】歡迎添加關注！文章轉載請注明出處。
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