本文提出一種具備串行或平行通道的數字PCR微流控芯片。
其中,在串行通道的芯片上 10.5 min 內可實現 99.5 ± 0.3% 的進樣效率。在并行通道的芯片上 2 min 內可實現 94.6 ± 0.9% 的進樣效率。
芯片結構如圖 1 所示。
圖 1
串行和平行通道芯片設計均采用標準 SU-8 光刻技術在 4“ 硅片上制造。
對于氣動層:首先在硅片表面采用 SU-8 2010 構建 10μm 高的基層,然后在此基層上用 SU-8 2025 構建 50μm 的高度。
對于流體層(圖 2):首先采用 SU-8 2010 構建 10μm 高的基層,然后使用 SU-8 2025 構建 50 μm 的通道層,最后使用 SU-8 2025 構建另一層高度為 50μm 的層,形成總高度為 100μm 的樣品裝載腔和微腔。
圖 2
隨后將PDMS澆筑在對應的模具上依次形成氣動層和流體層。同樣將PDMS澆筑在空白硅片上形成2mm厚的抗蒸發層。最后將三層粘接在一起形成完成的芯片。
為優化注液流程,將 2.5 μL 紅色染料注入入口儲液腔,然后通過氣動層施加的真空吸力引入樣品裝載腔,入口閥關閉。
當所有紅色染料流入樣品裝載腔后,入口儲液腔中加入 10μl FC-40 油。然后打開入口閥,出口閥被激活以執行芯片進樣通過真空驅動。
如圖 3 所示,作者設計了兩種不同類型的芯片(串聯通道 和 并行通道)。
兩種類型的芯片都有底部流體層和頂部氣動層組成,每個芯片由三個平行單元組成,用于高通量測量。
在每個單元中,樣品裝載腔通過一個主通道 或 16個并行通道連接到2000 個微孔陣列。
圖 3
為了實現無樣品損失的進樣,樣品體積必須小于總微孔體積。因此,樣品裝載腔被設計為可容納 2.5μl 的樣品,比 2000 個微孔的總體積小約 10% (一個微孔約 1.44 nL)。
微孔陣列兩側有兩個氣動閥來控制樣品導入和微孔填充。
圖4
如圖 4 所示,本文提出的芯片在“拉”模式和“推”模式之間實現微井的填充。
在“拉”模式下,出口閥關閉,通過傳統的真空驅動填充,主要通過主通道拉動溶液。
然后操作切換到“推”模式,打開出口閥,使主通道暴露在大氣中,由此試劑頭部與由溶液包裹的微孔之間形成壓力差。
此時在主通道和那些未完全填充的微井之間將建立一個壓力差。主通道中較高的壓力會改變流動方向,推動水相完全填充微孔。
重復拉推循環可將樣品完全分配到離散的微孔中,并被隨后的油相隔離。
圖 5
圖 5 所示為在“推”模式下,主通道中較高的壓力可以改變流體流動方向,驅動試劑完全填充微孔。
其對應視頻如視頻 2 所示。
視頻 2
為防止熱循環過程中試劑蒸發,如圖 6 所示,作者在芯片頂部組裝了防蒸發層和載玻片。
其中,PDMS 防蒸發層永久粘合在氣動層上,并含有一個腔室可填充超過 2 mL 的水。
圖 6
具備防蒸發層和未防蒸發層在PCR擴增后的圖如圖 7 所示。具備防蒸發層的芯片其陰陽性可明確辨別。
圖 7
審核編輯:劉清
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原文標題:一種無樣本損失微井數字PCR微流控芯片(附視頻)
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