青光眼是世界上導致失明的第二大原因。僅在美國,這一病癥就影響了約270萬人。它是一種復雜的疾病,如果不及時治療可能導致失明。這在澳大利亞也是個特別嚴重的問題,其中只有50%的人被確診為青光眼并接受相應的治療。
目前,IBM和紐約大學科學家團隊正在研究,可以利用深度學習來幫助眼科醫(yī)生和驗光師進一步檢測眼部圖像的新方法,這一方法也可有助于加快在圖像中檢測青光眼的過程。
在最近的一篇論文中,研究人員詳細介紹了一種新的深度學習框架,該框架直接從原始光學相干斷層掃描(OCT)成像中檢測青光眼,這種方法利用的是光波拍攝視網(wǎng)膜的橫截面圖像。該方法達到了94%的準確率,且無需對數(shù)據(jù)進行任何額外的分割或清理——通常在傳統(tǒng)的方法中這一步驟通常非常耗時。
青光眼(頂行)和健康眼(底行)中網(wǎng)絡檢測區(qū)域的可視化
現(xiàn)在,人們使用各種測試方法來診斷青光眼,例如眼壓測量和視野測試、眼底和OCT成像。但OCT提供了一種有效的方法來可視化和量化眼睛中的結(jié)構(gòu),即視網(wǎng)膜神經(jīng)纖維層(RNFL),它隨著疾病的進展而變化。
雖然這種方法效果良好,但它需要額外的過程來量化OCT圖像中的視網(wǎng)膜神經(jīng)纖維層。這些技術(shù)通常需要配合各種方式來對輸入數(shù)據(jù)進行處理,例如將所有眼睛圖片翻轉(zhuǎn)到相同的方向(左或右)以減少數(shù)據(jù)的可變性,從而改善分類器的性能。而研究人員新提出的方法消除了這些額外的步驟,保留了檢測中最重要的部分。
在624名受試者(217名健康受試者和432名青光眼患者)中,研究人員建立了利用深度學習進行檢測的新方法,準確地檢測出了94%的青光眼患者,而之前提到的技術(shù)僅發(fā)現(xiàn)了86%的患者。研究人員表示準確性的提升是由于對圖像中結(jié)構(gòu)自動分割錯誤的消除,以及新方法包含了目前臨床上尚未使用的眼底特征進行了分類。
此外,與目前使用更大更深層網(wǎng)絡的人工智能研究趨勢相反,研究人員使用的網(wǎng)絡是一個小型的5層網(wǎng)絡,這主要是由于醫(yī)療數(shù)據(jù)由于其隱私性不易獲取。這種數(shù)據(jù)稀缺使得大型網(wǎng)絡的使用在許多醫(yī)療應用中不切實際。即使在研究中有時也會看到“越少越佳”的特點,此外,在較小的網(wǎng)絡上訓練這些算法可以讓它們更高效地運行。
數(shù)據(jù)被輸入如下圖所示的卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(CNN)。網(wǎng)絡由5個3D卷積層組成,并使用ReLU激活和批量歸一化,濾波器組大小為32-32-32-32-32,濾波器尺寸為7-5-3-3-3,步幅為2-1-1-1-1。在最后的卷積層之后采用全局平均合并,并利用全連接的softmax輸出層以實現(xiàn)類標簽的預測和類激活圖(CAM)的計算。網(wǎng)絡架構(gòu)的一個重要方面是選擇3D卷積以允許計算3D類激活圖。卷積神經(jīng)網(wǎng)絡的5個輸入層沿第一維度(例如,顏色通道)聚合輸入數(shù)據(jù)。在2D卷積的情況下,所得到的類激活圖將是2D的,且深度信息丟失。因此通過采用3D卷積,這使我們能夠識別光學相干斷層掃描體積內(nèi)對疾病分類很重要的區(qū)域。
通過隨機超參數(shù)探索優(yōu)化了網(wǎng)絡體系結(jié)構(gòu)的各個方面,例如層數(shù)、每層濾波器組數(shù)、濾波器大小、步幅和批量歸一化的使用;類似于為基于特征的方法執(zhí)行的超參數(shù)優(yōu)化。網(wǎng)絡實現(xiàn)的曲線下面積用于選擇最佳網(wǎng)絡。研究人員從網(wǎng)絡架構(gòu)搜索中排除了最大池化,因為它可以被stride卷積取代。
卷積神經(jīng)網(wǎng)絡在Keras中實現(xiàn),Tensorflow作為后端。使用nut-flow/ml進行數(shù)據(jù)分離、分層和預處理。通過降采樣,每個階段對數(shù)據(jù)進行分層。通過隨機遮擋、平移、左右眼翻轉(zhuǎn)、沿著表面軸的小旋轉(zhuǎn)(±10度)和混合來增強訓練數(shù)據(jù)。同時研究人員還在沒有任何擴充的情況下訓練了網(wǎng)絡,并報告了相應的曲線下面積。在訓練期間具有最高準確度的曲線下面積的網(wǎng)絡被保存。
這只是IBM目前研究應用人工智能的一個方面。在最近宣布的新合作中,IBM Research和George&Matilda (G&M) 將利用G&M強大的匿名臨床數(shù)據(jù)和成像研究數(shù)據(jù)集,來探索使用深度學習模型和成像分析的方法,以支持臨床醫(yī)生在圖像中識別和檢測眼部疾病——包括青光眼。研究人員還將研究青光眼的潛在生物標志物,這有助于更好地了解疾病進展。
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原文標題:治愈系 | 深度學習 & 青光眼
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