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基于深度學(xué)習(xí)的MiRNA靶位點預(yù)測研究綜述

2021-04-20 | pdf | 1.86 MB | 次下載 | 免費

資料介紹

  Micrornas( mirnas)是一類長約22~23堿基(nt)的單鏈非編碼RNA,在生物進(jìn)化方面有著重要意義。成熟的MIRNA會通過其種子序列(5‘第2-8位核苷酸)與 message Rnas( MRNAS)的3’UTR區(qū)域靶位點進(jìn)行完全或不完全配對,實現(xiàn)切割mRNA及抑制mRNA翻譯等功能。由于 mirna結(jié)合mRNA靶位點的機制仍未明確,因此預(yù)測 MIRNA靶位點的工作一直是 MIRNA研究領(lǐng)域的一大挑戰(zhàn)和難題。實驗方法雖然準(zhǔn)確,但耗時長且昂貴。在生物信息領(lǐng)域,基于規(guī)則匹配的常規(guī)計算方法雖然能進(jìn)行靶位點的預(yù)測,但存在著準(zhǔn)確率偏低的問題。隨著深度學(xué)習(xí)的興起及實驗驗證數(shù)據(jù)及具體靶位點信息的豐富,基于深度學(xué)習(xí)的方法成為了 MIRNA靶位點預(yù)測領(lǐng)堿的硏究熱點。首先介紹了常用的 MIRNA預(yù)測數(shù)據(jù)集、預(yù)測類型和常見特征;之后對預(yù)測研究中常用的深度學(xué)習(xí)模型進(jìn)行闡述;接著介紹了常規(guī)的預(yù)測方法及基于深度學(xué)習(xí)的預(yù)測方法,并對這些方法進(jìn)行了分類總結(jié)和性能的對比分析;最后對使用深度學(xué)習(xí)的預(yù)測工作當(dāng)前存在的問題及未來的發(fā)展進(jìn)行了探討。

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