資料介紹
描述
第二波 Covid-19 導(dǎo)致的死亡人數(shù)增加
在第二波中,大多數(shù)人口稠密的國家受到了很大的影響。這些是錯誤率高的主要原因。
大流行期間醫(yī)療領(lǐng)域的挑戰(zhàn):
?醫(yī)生/專家全心全意照顧入院患者。
?在人口稠密的國家,分析從物聯(lián)網(wǎng)醫(yī)療設(shè)備接收到的數(shù)據(jù)需要更多的人力。
?由于缺乏互聯(lián)網(wǎng)設(shè)施,在大流行期間評估農(nóng)村地區(qū)的家庭隔離患者是一個繁瑣的過程。
?對患者的嚴重程度進行分類需要更多的時間,并且需要更多的床位占用來分析患者狀態(tài)。
解決大流行問題的技術(shù)貢獻:
?由Edge Impulse 驅(qū)動的Covid 患者健康評估設(shè)備將分析患者的SpO2、心率、體溫和呼吸頻率。
? TinyML 模型由醫(yī)學指南建議的數(shù)據(jù)集進行訓(xùn)練。
?與物聯(lián)網(wǎng)設(shè)備相比,延遲最低
? 15Kb Rom – 健康評估 TinyML 模型可以在任何支持 TinyML 的微控制器上運行。
?設(shè)備將分析健康狀況并分類為穩(wěn)定、嚴重、健康:惡化
建筑學:
Covid專利健康評估設(shè)備包括:
- 使用 google colab 生成健康數(shù)據(jù)集
- Edge Impulse 中的數(shù)據(jù)采集
- Edge Impulse 中的模型訓(xùn)練
- 實時傳感器集成
- 模型部署
醫(yī)療指南:
在下圖中,0 分表示穩(wěn)定,1 分表示輕度,2 分表示中等,3 分表示嚴重。
0分表示氧氣水平>96的穩(wěn)定人,其中3分表示氧氣水平<90并需要ICU支持。
健康風險狀態(tài)算法:
我開發(fā)了一種算法來計算基于 SpO2、呼吸頻率、心率和體溫的愈合指數(shù)。
SpO2 具有較高的權(quán)重 (40)、RR (30)、心率 (20) 和溫度 (10)。將較高權(quán)重分配給 SpO2 的原因是 SpO2 健康參數(shù)對于識別患者的健康狀況更為關(guān)鍵。SpO2 的風險因子為 2。
健康指數(shù)將按以下公式計算:
Health Index = ((40-((100-spo2)*2))+(30-((RR-CAL_RR)*1.5))+(20-(CAL_PULSE-pulse))+(10-((Temperature-CAL_TEMP))));
使用 google colab 生成數(shù)據(jù)集:
我為以下條件創(chuàng)建了 SpO2、RR、心率和溫度的數(shù)據(jù)集:
- 穩(wěn)定的
- 溫和的
- 緩和
- 批判的
請使用下面的 GitHub 鏈接創(chuàng)建數(shù)據(jù)集。
https://github.com/Manivannan-maker/CovidPatientHealhAssessingDevice/blob/main/Healthdata.ipynb
從您的 google 帳戶登錄運行 google colab 中的代碼。
數(shù)據(jù)集將以 .csv 格式保存在 Drive 文件夾中。
數(shù)據(jù)采集?? :
該項目的單個數(shù)據(jù)集需要 3 小時的數(shù)據(jù)。所以對于 40 個數(shù)據(jù)集,要讓它變得簡單需要 120 多個小時,我已經(jīng)接近了替代方法。
數(shù)據(jù)采集??工作基于以下流程:
我已將 google colab 中的數(shù)據(jù)緩沖區(qū)復(fù)制到 Arduino 中,數(shù)據(jù)選擇基于電位器位置。
基于電位器的調(diào)整,健康指數(shù)算法將從不同的數(shù)據(jù)集(穩(wěn)定、輕度、中度和危急)中獲取輸入。我已將帶有 goggle colab 數(shù)據(jù)集的數(shù)據(jù)采集代碼附加為數(shù)組緩沖區(qū)。
輸入:170 分鐘健康指數(shù)數(shù)據(jù)
算法會將 170 分鐘轉(zhuǎn)換為 59 秒的數(shù)據(jù)時間范圍。
輸出:500ms 干擾延遲內(nèi)的健康指數(shù)數(shù)據(jù)。
Edge Impulse 中的數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)發(fā):
我已經(jīng)使用數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)發(fā)命令將數(shù)據(jù)集上傳到邊緣脈沖。請參考以下文檔。
$ edge-impulse-data-forwarder
Name
標簽為“健康指數(shù)”。
數(shù)據(jù)集:健康惡化:
健康 - 穩(wěn)定:
健康 - 關(guān)鍵:
創(chuàng)造沖動:
NN分類器:
在NN 分類器中,以專家模式 (keras) 編輯。
import tensorflow as tf
from tensorflow.keras.models import Sequential
from tensorflow.keras.layers import Dense, InputLayer, Dropout, Conv1D, Conv2D, Flatten, Reshape, MaxPooling1D, MaxPooling2D, BatchNormalization
from tensorflow.keras.optimizers import Adam
sys.path.append('./resources/libraries')
import ei_tensorflow.training
# model architecture
model = Sequential()
model.add(Flatten())
model.add(Dense(32,
activity_regularizer=tf.keras.regularizers.l1(0.00001)))
model.add(Dense(16,
activity_regularizer=tf.keras.regularizers.l1(0.00001)))
model.add(Dense(8,
activity_regularizer=tf.keras.regularizers.l1(0.00001)))
model.add(Dense(4,
activity_regularizer=tf.keras.regularizers.l1(0.00001)))
model.add(Dense(classes, activation='softmax', name='y_pred'))
# this controls the learning rate
opt = Adam(lr=0.0005, beta_1=0.9, beta_2=0.999)
# this controls the batch size, or you can manipulate the tf.data.Dataset objects yourself
BATCH_SIZE = 32
train_dataset = train_dataset.batch(BATCH_SIZE, drop_remainder=False)
validation_dataset = validation_dataset.batch(BATCH_SIZE, drop_remainder=False)
callbacks.append(BatchLoggerCallback(BATCH_SIZE, train_sample_count))
# train the neural network
model.compile(loss='categorical_crossentropy', optimizer=opt, metrics=['accuracy'])
model.fit(train_dataset, epochs=500, validation_data=validation_dataset, verbose=2, callbacks=callbacks)
我已經(jīng)刪除了所有神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)中的“activation= Relu”,因為數(shù)據(jù)總是正值。
神經(jīng)層形成如下:
模型訓(xùn)練:
模型部署:
選擇部署中的 Arduino 并構(gòu)建它。正在下載您項目的 zip 文件。
請確保將庫包含在 Arduino 中。
代碼集成:
將 zip 文件添加到庫后,從 GitHub 下載以下應(yīng)用程序代碼。應(yīng)用程序代碼將包含 SSD1306、Max30102 接口功能。
免責聲明:
該項目是基于指南和研究論文的概念驗證。請不要在未經(jīng)政府/醫(yī)學認證批準的情況下直接在患者身上進行測試。
我開發(fā)這個原型是為了讓我們?yōu)閼?yīng)對第三波做好準備。我相信人類很快就會戰(zhàn)勝這場流行病。
?
- 使用Edge Impulse關(guān)鍵字識別控制筆記本電腦
- 帶有M5Stack和Edge Impulse的手勢控制無人機
- 使用Edge Impulse和Nvidia Jetson的面罩檢測器
- 使用XIAO BLE Sense&Edge Impulse的寵物活動追蹤器
- 在MaaXBoard Mini上使用Edge Impulse進行安全帽檢測
- 使用Edge Impulse在pico上進行手勢識別
- 通過Edge Impulse開始使用TinyML
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