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人類(lèi)基因組計(jì)劃的成果推動(dòng)生物信息學(xué)研究的發(fā)展．基于疾病表型相似性策略尋找功能上存在聯(lián)系的致病基因，稱(chēng)作“表型相似基因”，具有重要的研究?jī)r(jià)值和廣闊的應(yīng)用前景，成為一個(gè)新興的研究熱點(diǎn)，然而，生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域尚沒(méi)有利用計(jì)算機(jī)方法開(kāi)展基于“基因一疾病一表型”關(guān)系網(wǎng)絡(luò)的表型相似基因搜索研究．對(duì)此。利用疾病公開(kāi)數(shù)據(jù)庫(kù)構(gòu)建了包含基因、疾病、表型這三類(lèi)異構(gòu)類(lèi)型節(jié)點(diǎn)的疾病信息網(wǎng)絡(luò)。并設(shè)計(jì)了基于疾病信息網(wǎng)絡(luò)的相似基因搜索算法gSim-Miner.針對(duì)疾病表型數(shù)據(jù)的特點(diǎn)，設(shè)計(jì)了剪枝策略提高算法效率．通過(guò)在真實(shí)數(shù)據(jù)上的實(shí)驗(yàn)，驗(yàn)證了疾病信息網(wǎng)絡(luò)對(duì)搜索表型相似基因的適用性，以及gSim-Miner算法的有效性，執(zhí)行效率和可擴(kuò)展性．
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