資料介紹
禁忌搜索算法是一種局部搜索能力很強的全局迭代優(yōu)化算法,已經被成功地應用到各種組合優(yōu)化問題中。基于AB 非格模型,該文將一種改進的禁忌搜索算法應用于蛋白質三維折疊結構預測。實驗結果表明改進的禁忌算法求得的蛋白質三維最低能量構形的最低能量值比已有的算法求得的最低能量值要低,同時三維構形中形成了一個疏水核,被親水殘基包圍,反映了真實蛋白質的結構特征。該算法效率高,可以有效地用于蛋白質三維折疊預測。
關鍵詞:禁忌搜索算法;蛋白質三維折疊;AB 非格模型
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